Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smim3Q99PE5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim3Q99PE5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms