Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tsnaxip1Q99P25 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tsnaxip1Q99P25 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms