Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ms4a6bQ99N09 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ms4a6bQ99N09 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms