Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krcc1Q99JT5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Krcc1Q99JT5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Krcc1Q99JT5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms