Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Spdl1Q923A2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Spdl1Q923A2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spdl1Q923A2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms