Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cabp4Q8VHC5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cabp4Q8VHC5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cabp4Q8VHC5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms