Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt79Q8VED5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt79Q8VED5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt79Q8VED5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms