Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdk8Q8R3L8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk8Q8R3L8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms