Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Shtn1Q8K2Q9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shtn1Q8K2Q9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shtn1Q8K2Q9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms