Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
1700001C19RikQ8K168 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
1700001C19RikQ8K168 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
1700001C19RikQ8K168 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms