Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ClasrpQ8CFC7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ClasrpQ8CFC7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClasrpQ8CFC7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms