Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc15Q8C9M2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc15Q8C9M2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms