Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8B0

Alx1, ALX homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx1Q8C8B0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Alx1Q8C8B0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Alx1Q8C8B0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Alx1Q8C8B0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms