Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snapc4Q8BP86 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snapc4Q8BP86 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snapc4Q8BP86 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms