Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Grik4Q8BMF5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Grik4Q8BMF5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms