Protein–RNA interactions for Protein: Q811G0

Bbs9, Protein PTHB1, mousemouse

Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs9Q811G0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Bbs9Q811G0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Bbs9Q811G0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms