Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SnphQ80U23 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Gm42726-201ENSMUST00000202274 1286 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SnphQ80U23 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SnphQ80U23 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms