Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HhipQ7TN16 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HhipQ7TN16 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms