Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Cnot1Q6ZQ08 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cnot1Q6ZQ08 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnot1Q6ZQ08 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms