Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ecm29Q6PDI5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ecm29Q6PDI5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ecm29Q6PDI5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms