Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6PD19 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6PD19 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6PD19 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Q6PD19 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6PD19 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6PD19 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Q6PD19 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Q6PD19 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6PD19 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q6PD19 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6PD19 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6PD19 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q6PD19 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q6PD19 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q6PD19 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q6PD19 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q6PD19 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q6PD19 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q6PD19 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Q6PD19 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6PD19 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6PD19 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6PD19 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6PD19 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6PD19 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6PD19 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6PD19 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6PD19 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6PD19 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6PD19 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q6PD19 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q6PD19 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q6PD19 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q6PD19 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q6PD19 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q6PD19 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6PD19 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6PD19 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6PD19 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6PD19 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6PD19 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6PD19 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6PD19 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6PD19 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q6PD19 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6PD19 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6PD19 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6PD19 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6PD19 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6PD19 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6PD19 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6PD19 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6PD19 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6PD19 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6PD19 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q6PD19 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6PD19 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6PD19 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6PD19 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6PD19 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6PD19 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6PD19 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6PD19 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6PD19 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6PD19 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6PD19 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6PD19 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q6PD19 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6PD19 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6PD19 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6PD19 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6PD19 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6PD19 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6PD19 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6PD19 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6PD19 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q6PD19 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q6PD19 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6PD19 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6PD19 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6PD19 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6PD19 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6PD19 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6PD19 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6PD19 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6PD19 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6PD19 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6PD19 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6PD19 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q6PD19 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6PD19 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6PD19 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6PD19 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6PD19 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6PD19 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6PD19 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6PD19 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6PD19 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q6PD19 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.3 ms