Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hdac4Q6NZM9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hdac4Q6NZM9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms