Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Szrd1Q6NXN1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Szrd1Q6NXN1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Szrd1Q6NXN1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms