Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Bfsp2Q6NVD9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Bfsp2Q6NVD9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms