Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rftn1Q6A0D4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rftn1Q6A0D4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rftn1Q6A0D4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.2 ms