Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Thsd7aQ69ZU6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Thsd7aQ69ZU6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Thsd7aQ69ZU6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Thsd7aQ69ZU6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms