Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nlrp4eQ66X19 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nlrp4eQ66X19 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms