Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Clcn1Q64347 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
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Clcn1Q64347 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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Clcn1Q64347 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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Clcn1Q64347 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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Clcn1Q64347 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
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Clcn1Q64347 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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Clcn1Q64347 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Clcn1Q64347 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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Clcn1Q64347 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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Clcn1Q64347 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clcn1Q64347 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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