Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim25Q61510 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim25Q61510 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim25Q61510 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim25Q61510 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim25Q61510 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Trim25Q61510 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim25Q61510 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim25Q61510 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim25Q61510 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim25Q61510 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim25Q61510 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim25Q61510 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim25Q61510 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim25Q61510 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim25Q61510 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim25Q61510 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim25Q61510 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim25Q61510 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim25Q61510 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim25Q61510 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms