Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mre11Q61216 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Mre11Q61216 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mre11Q61216 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.7 ms