Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Traf3Q60803 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Traf3Q60803 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms