Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm1Q60636 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prdm1Q60636 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prdm1Q60636 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms