Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms