Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynrgQ5SV85 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynrgQ5SV85 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynrgQ5SV85 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynrgQ5SV85 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynrgQ5SV85 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynrgQ5SV85 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SynrgQ5SV85 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SynrgQ5SV85 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SynrgQ5SV85 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SynrgQ5SV85 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SynrgQ5SV85 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SynrgQ5SV85 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SynrgQ5SV85 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms