Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim58Q5NCC9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim58Q5NCC9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim58Q5NCC9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms