Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prkaa1Q5EG47 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prkaa1Q5EG47 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms