Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rtl5Q5DTT4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Rtl5Q5DTT4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rtl5Q5DTT4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms