Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmtc2Q56A06 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmtc2Q56A06 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmtc2Q56A06 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms