Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prpf38aQ4FK66 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prpf38aQ4FK66 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf38aQ4FK66 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf38aQ4FK66 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf38aQ4FK66 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf38aQ4FK66 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf38aQ4FK66 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prpf38aQ4FK66 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf38aQ4FK66 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf38aQ4FK66 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf38aQ4FK66 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf38aQ4FK66 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf38aQ4FK66 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf38aQ4FK66 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prpf38aQ4FK66 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms