Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BB287469Q3UT53 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BB287469Q3UT53 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 792.2 ms