Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ctsll3Q3ULP7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctsll3Q3ULP7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctsll3Q3ULP7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms