Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VrtnQ3SYK4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VrtnQ3SYK4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VrtnQ3SYK4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms