Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpusd2Q149F1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpusd2Q149F1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpusd2Q149F1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms