Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pate4Q09098 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pate4Q09098 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms