Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MitfQ08874 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MitfQ08874 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MitfQ08874 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MitfQ08874 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms