Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MestQ07646 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MestQ07646 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MestQ07646 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MestQ07646 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MestQ07646 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MestQ07646 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MestQ07646 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MestQ07646 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MestQ07646 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MestQ07646 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MestQ07646 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MestQ07646 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MestQ07646 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MestQ07646 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MestQ07646 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MestQ07646 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MestQ07646 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MestQ07646 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MestQ07646 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MestQ07646 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MestQ07646 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MestQ07646 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MestQ07646 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MestQ07646 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MestQ07646 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MestQ07646 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MestQ07646 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MestQ07646 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MestQ07646 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
MestQ07646 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MestQ07646 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MestQ07646 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
MestQ07646 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
MestQ07646 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
MestQ07646 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MestQ07646 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MestQ07646 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MestQ07646 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MestQ07646 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MestQ07646 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MestQ07646 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MestQ07646 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MestQ07646 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MestQ07646 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MestQ07646 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MestQ07646 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
MestQ07646 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
MestQ07646 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MestQ07646 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MestQ07646 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MestQ07646 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MestQ07646 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MestQ07646 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MestQ07646 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
MestQ07646 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
MestQ07646 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
MestQ07646 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
MestQ07646 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MestQ07646 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MestQ07646 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MestQ07646 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MestQ07646 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
MestQ07646 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
MestQ07646 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MestQ07646 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MestQ07646 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MestQ07646 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MestQ07646 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MestQ07646 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MestQ07646 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MestQ07646 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
MestQ07646 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
MestQ07646 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms