Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn1r236Q05A06 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r236Q05A06 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms