Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VldlrP98156 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VldlrP98156 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VldlrP98156 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VldlrP98156 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VldlrP98156 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VldlrP98156 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms