Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Xrn1P97789 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Xrn1P97789 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Xrn1P97789 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Xrn1P97789 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Xrn1P97789 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Xrn1P97789 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Xrn1P97789 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Xrn1P97789 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Xrn1P97789 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Xrn1P97789 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Xrn1P97789 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Xrn1P97789 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Xrn1P97789 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Xrn1P97789 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Xrn1P97789 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Xrn1P97789 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms