Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Taf1bP97358 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Taf1bP97358 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms